区域控制站(RTU)通过本地IO接口或远程控制站(RIO)实现控制，即A选项正确；同时“每个区域控制站(RTU)也可按预先输入的程序控制现场设备运行”，即B选项正确；并且“VI/CO值、风向/风速值、亮度值等可通过区域控制站(RTU)或远程控制站(RIO)采集，然后上传到隧道监控中心”，即C选项正确。D选项错误，与省高速公路通信专网实现互联互通是通信系统的功能，而非RTU的直接功能。