正确答案为A、C。在公路综合甲级检测机构中设有交通安全设施专业，在交通工程专项中设有全部交通工程专业。选项B错误，原文未提及公路综合乙级设有全部交通工程专业；选项D错误，交通工程专项中设有的是全部交通工程专业，而非仅设交通安全设施专业。